Thượng viện có nguồn gốc từ Ủy ban Philippine of the Chính quyền Quần đảo. Dưới Đạo luật Cơ quan Philippine, từ 1907 tới 1916, Ủy ban Philippine đứng đầu là Toàn quyền Philippines phục vụ như thượng viện của Lập pháp Philippine, với Hội nghị Philippine được bầu là hạ viện. Đồng thời các Toàn quyền thực hiện quyền hành pháp.

Trong ngày 29/8/1916, Quốc hội Mỹ đã ban hành Đạo luật Tự chủ Philippine hay thường được gọi là "Luật Jones", thành lập lưỡng viện Lập pháp Philippine với thượng viện và Viện Dân biểu, đổi tên Hội nghị Philippine, là hạ viện. Toàn quyền vẫn là người đứng đầu ngành hành pháp của Chính phủ Quần đảo.

Sau đó Ủy viên Thường trú Philippine Manuel L. Quezon động viên người phát ngôn Sergio Osmeña chạy đua tới chức vụ lãnh đạo của Thượng nghị viện, nhưng Osmeña thích tiếp tục lãnh đạo Hạ viện hơn. Quezon sau đó ra tranh cử Thượng viện và trở thành Chủ tịch Thượng nghị viện trong 19 năm tiếp theo (1916-1935). Thượng nghị sĩ rồi được bầu qua khu vực bầu cử theo hệ thống đa số chiến thắng; mỗi khu vực tập hợp lại từ vài tỉnh và mỗi khu vực bầu chọn hai Thượng nghị sĩ, ngoại trừ các khu vực "phi Cơ Đốc" nơi Toàn quyền chỉ định Thượng nghị sĩ cho khu vực.

Thiết lập này tiếp tục cho đến năm 1935, khi Đạo luật Philippine Độc lập hoặc" Đạo luật Tydings - McDuffie" đã được thông qua bởi Quốc hội Hoa Kỳ cấp cho Philippines quyền được lập hiến pháp riêng chuẩn bị cho sự độc lập, trong đó họ thành lập Quốc hội độc viện, bãi bỏ Thượng nghị viện. Không lâu sau khi thông qua Hiến pháp năm 1935 vài sửa đổi bắt đầu được đề xuất. Trước năm 1938, Quốc hội bắt đầu xem xét đề xuất này, bao gồm khôi phục lại Thượng nghị viện như thượng viện của Quốc hội. Sửa đổi Hiến pháp năm 1935 để lập lưỡng viện lập pháp được chấp thuận vào năm 1940 và cuộc bầu cử thượng viện khôi phục lại được tổ chức vào tháng 11 năm 1941. Thay vì thượng nghị sĩ được phân bổ theo khu vực, Thượng nghị sĩ được bầu toàn bộ quốc gia có tác dụng như đa số khu vực, mặc dù vẫn do đa số biểu quyết, với cử tri bỏ phiếu trên 8 ứng viên, và 8 ứng viên với số phiếu cao nhất được bầu chọn. Trong khi Thượng viện 1916-1935 có quyền xác nhận độc quyền việc bổ nhiệm chủ tịch hành pháp, như một phần của thỏa hiệp Thượng viện vào năm 1941, quyền hạn xác nhận được thực hiện bởi một liên Ủy ban bổ nhiệm gồm các thành viên của cả hai viện. Tuy nhiên, Thượng viện kể từ khi phục hồi và độc lập vào năm 1946 có quyền phê chuẩn các hiệp ước.

Thượng viện cuối cùng đã được triệu tập vào năm 1945 và phục vụ như là thượng viện của Quốc hội cho đến khi tuyên bố thiết quân luật của Tổng thống Ferdinand Marcos năm 1972, bãi bỏ Quốc hội. Thượng viện đã được hồi phục năm 1987 khi Hiến pháp 1987 được phê chuẩn. Tuy nhiên, thay vì 8 thượng nghị sĩ được thay thế sau mỗi cuộc bầu cử, nó đã thay đổi đến 12.